MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017857	GCCA	2	8	2815876	2815883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_017857	AAT	2	6	2819146	2819151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_017857	GT	3	6	2819196	2819201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_017857	TTAT	2	8	2822010	2822017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_017857	CCA	2	6	2822027	2822032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_017857	CTG	2	6	2822033	2822038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_017857	T	6	6	2822046	2822051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_017857	GGT	2	6	2824332	2824337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_017857	GAT	2	6	2824360	2824365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_017857	GT	3	6	2825489	2825494	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_017857	TGC	2	6	2825520	2825525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_017857	TAA	2	6	2825601	2825606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017857	TAA	2	6	2826584	2826589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017857	TG	3	6	2826596	2826601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_017857	ATTA	2	8	2826662	2826669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017857	A	7	7	2826702	2826708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017857	A	6	6	2827954	2827959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_017857	TGAAA	2	10	2827963	2827972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_017857	TTG	2	6	2829928	2829933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_017857	GTC	2	6	2829976	2829981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_017857	ATTTAG	2	12	2830035	2830046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_017857	ATG	2	6	2830090	2830095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_017857	CAAAT	2	10	2830102	2830111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6524	NC_017857	ATG	2	6	2830127	2830132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_017857	GCAT	2	8	2830146	2830153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_017857	CTG	2	6	2830195	2830200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_017857	TAT	2	6	2830299	2830304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_017857	TAA	2	6	2834975	2834980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_017857	GTTT	2	8	2835000	2835007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_017857	TA	3	6	2835019	2835024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017857	CCT	2	6	2835038	2835043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_017857	TGC	2	6	2835128	2835133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_017857	A	6	6	2835145	2835150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_017857	ACGC	2	8	2835200	2835207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_017857	TA	3	6	2835213	2835218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_017857	T	7	7	2835243	2835249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_017857	TTGCCG	2	12	2836107	2836118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_017857	TGT	2	6	2836172	2836177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_017857	TGCT	2	8	2837135	2837142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6540	NC_017857	AC	3	6	2837183	2837188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_017857	TAT	2	6	2837200	2837205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017857	ACG	2	6	2837212	2837217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_017857	CA	3	6	2837218	2837223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6544	NC_017857	CCA	2	6	2838567	2838572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_017857	CTG	2	6	2838573	2838578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_017857	T	6	6	2838586	2838591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_017857	GTT	2	6	2838623	2838628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_017857	CTC	2	6	2838745	2838750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_017857	TTGA	2	8	2838756	2838763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_017857	T	7	7	2838767	2838773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_017857	CAAT	2	8	2839114	2839121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_017857	CTG	2	6	2839128	2839133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_017857	TTA	2	6	2839141	2839146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017857	AAT	2	6	2839568	2839573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_017857	TCTA	2	8	2840783	2840790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6556	NC_017857	TTA	2	6	2840807	2840812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_017857	ATT	2	6	2840838	2840843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_017857	TAT	2	6	2840905	2840910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_017857	TGT	2	6	2840923	2840928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_017857	ATA	2	6	2840931	2840936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_017857	AGG	2	6	2840949	2840954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_017857	TAT	2	6	2841509	2841514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_017857	TTC	2	6	2841528	2841533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_017857	AAT	2	6	2841553	2841558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_017857	ACG	3	9	2841758	2841766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_017857	TCG	2	6	2841784	2841789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_017857	TGT	2	6	2841799	2841804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_017857	TGA	2	6	2841835	2841840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_017857	CCT	2	6	2841865	2841870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_017857	ATC	2	6	2841883	2841888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_017857	T	7	7	2842240	2842246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_017857	AAT	2	6	2842278	2842283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_017857	AAAT	2	8	2842290	2842297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_017857	T	7	7	2842300	2842306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017857	GTG	2	6	2842757	2842762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_017857	TTG	2	6	2842799	2842804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_017857	TGT	2	6	2842823	2842828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_017857	A	6	6	2842835	2842840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_017857	TCAA	2	8	2842843	2842850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_017857	GAG	2	6	2842856	2842861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_017857	CGA	2	6	2842886	2842891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_017857	AAC	2	6	2842978	2842983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_017857	CAT	2	6	2842991	2842996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_017857	A	6	6	2843014	2843019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_017857	GCC	2	6	2843022	2843027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_017857	GTG	2	6	2843032	2843037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_017857	CA	3	6	2844818	2844823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6588	NC_017857	AC	3	6	2844884	2844889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_017857	TCA	2	6	2844912	2844917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_017857	TGT	2	6	2846543	2846548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_017857	ATT	2	6	2846562	2846567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_017857	ATG	2	6	2846652	2846657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_017857	ATC	2	6	2846673	2846678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_017857	T	6	6	2848958	2848963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_017857	TCT	2	6	2848969	2848974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_017857	AAT	2	6	2849035	2849040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_017857	TTA	2	6	2849067	2849072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_017857	AAT	2	6	2849115	2849120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_017857	ATT	2	6	2852188	2852193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_017857	GAC	2	6	2853621	2853626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_017857	CAA	2	6	2853646	2853651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_017857	AAAC	2	8	2853652	2853659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6603	NC_017857	TACA	2	8	2853665	2853672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_017857	A	7	7	2853672	2853678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_017857	TCG	2	6	2853748	2853753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_017857	T	6	6	2853768	2853773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_017857	GTGA	2	8	2853824	2853831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_017857	T	8	8	2858340	2858347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_017857	ATT	2	6	2859667	2859672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_017857	TTTA	2	8	2859787	2859794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_017857	TGA	2	6	2859798	2859803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_017857	CAC	2	6	2862652	2862657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_017857	TCG	2	6	2863279	2863284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_017857	CTA	2	6	2865483	2865488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_017857	TGG	2	6	2865508	2865513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_017857	A	6	6	2870757	2870762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_017857	A	6	6	2877042	2877047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_017857	ACAA	2	8	2877053	2877060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6619	NC_017857	GAC	2	6	2878267	2878272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_017857	CAT	2	6	2880137	2880142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_017857	A	6	6	2880160	2880165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_017857	CAG	2	6	2880173	2880178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_017857	TGG	2	6	2880179	2880184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_017857	T	7	7	2880221	2880227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_017857	ATG	2	6	2882465	2882470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_017857	GTCA	2	8	2882485	2882492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_017857	A	7	7	2882946	2882952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_017857	T	9	9	2882971	2882979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_017857	TCA	2	6	2882981	2882986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_017857	ATT	2	6	2883003	2883008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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